الوصف
قاعدة بيانات MIMIC-III السريرية الإصدار 1.4، التي صدرت في 4 سبتمبر 2016، هي مورد كبير ومتاح مجانًا للباحثين في جميع أنحاء العالم. تتألف من بيانات صحية مجهولة الهوية لأكثر من أربعين ألف مريض تلقوا الرعاية في وحدات العناية المركزة في مركز بيث إسرائيل ديكونيس الطبي بين عامي 2001 و 2012. تتضمن هذه المجموعة الضخمة من البيانات مجموعة واسعة من المعلومات، مثل التركيبة السكانية للمرضى، قياسات العلامات الحيوية كل ساعة، نتائج الفحوصات المخبرية، تفاصيل الإجراءات والأدوية التي تم إعطاؤها، ملاحظات مقدمي الرعاية، تقارير التصوير، وبيانات الوفيات، وتمتد حتى ما بعد الخروج من المستشفى.
تم تنظيم قاعدة البيانات كقاعدة بيانات علائقية تحتوي على 26 جدولًا، مرتبطة بمعرفات مثل SUBJECT_ID، HADM_ID، و ICUSTAY_ID. تتضمن بيانات من مصادر مختلفة، بما في ذلك أنظمة معلومات العناية المركزة (Philips CareVue و iMDsoft MetaVision ICU)، وقواعد بيانات السجلات الصحية الإلكترونية للمستشفيات، وملف الوفيات الخاص بإدارة الضمان الاجتماعي. تخضع البيانات لعملية إزالة هوية صارمة وفقًا لمعايير HIPAA، بما في ذلك تنقية البيانات المنظمة وتحويل التواريخ للحفاظ على الفواصل الزمنية مع إخفاء هويات المرضى. يتم تحويل التواريخ إلى المستقبل، ويتم إخفاء أعمار المرضى الذين تزيد أعمارهم عن 89 عامًا.
تتميز MIMIC-III بإمكانية الوصول إليها، والعدد الكبير والمتنوع من مرضى وحدات العناية المركزة الذين تمثلهم، والطبيعة التفصيلية للغاية لبياناتها. هذا يجعلها أداة لا تقدر بثمن لمجموعة واسعة من الدراسات التحليلية، بما في ذلك علم الأوبئة، وتحسين قواعد القرارات السريرية، وتطوير أدوات الصحة الإلكترونية. يتم توفير قاعدة البيانات كمجموعة من ملفات CSV، مصحوبة ببرامج نصية للاستيراد في أنظمة قواعد بيانات مختلفة مثل PostgreSQL، MySQL، و MonetDB. يتطلب الوصول إلى البيانات إكمال تدريب للمستخدمين المعتمدين في حماية المشاركين في الأبحاث البشرية وتوقيع اتفاقية استخدام البيانات.
قدم الإصدار 1.4 تحسينات كبيرة، بما في ذلك إضافة بيانات نصية من القوائم المنسدلة لمرضى Metavision، وتصحيح نطاقات البيانات، واستعادة البيانات المفقودة بسبب انتقالات النظام، ومواءمة مفاهيم المختبر، وتحسين تمثيل قيم NULL في ملفات CSV. كما ميزت الإضافات إلى ملخصات الخروج وصححت رموز LOINC وبيانات المنطقة الزمنية. قاعدة البيانات متاحة الآن أيضًا على Google Cloud Platform (GCP) و Amazon Web Services (AWS)، مع توفير دروس تعليمية لاستخدامها مع BigQuery و Athena على التوالي.
أبرز ملامح قاعدة بيانات MIMIC-III السريرية الإصدار 1.4
بيانات سريرية مجهولة الهوية لأكثر من 40,000 مريض في وحدات العناية المركزة
تشمل التركيبة السكانية، العلامات الحيوية، نتائج المختبر، الأدوية، والملاحظات
تمتد البيانات من عام 2001 إلى عام 2012
متاحة مجانًا للباحثين المعتمدين في جميع أنحاء العالم
عملية إزالة هوية صارمة متوافقة مع معايير HIPAA
منظمة كقاعدة بيانات علائقية تحتوي على 26 جدولًا
متاحة على Google Cloud Platform (GCP) و Amazon Web Services (AWS)
تدعم الأبحاث في علم الأوبئة، تحسين قواعد القرارات السريرية، وتطوير الأدوات
بيانات تفصيلية للغاية، بما في ذلك قياسات فسيولوجية كل ساعة
تشمل بيانات الوفيات، سواء داخل المستشفى أو بعد الخروج
يتم توفير البيانات بتنسيق CSV مع برامج نصية للاستيراد
تتطلب إكمال تدريب حماية المشاركين في الأبحاث البشرية
تتطلب توقيع اتفاقية استخدام البيانات
البدء مع قاعدة بيانات MIMIC-III السريرية الإصدار 1.4
الوصول إلى النموذج: انتقل إلى physionet.org وحدد موقع قاعدة بيانات MIMIC-III.
الاعتماد: أكمل تدريب CITI المطلوب للبيانات أو العينات فقط.
اتفاقية استخدام البيانات: قم بتوقيع اتفاقية استخدام بيانات الصحة المعتمدة من PhysioNet.
تنزيل البيانات: بمجرد الموافقة، قم بتنزيل ملفات قاعدة البيانات من PhysioNetWorks.
دمج البيانات: استخدم البرامج النصية المقدمة لاستيراد بيانات CSV إلى نظام قاعدة البيانات الذي تختاره.
تحليل البيانات: ابدأ البحث باستخدام المعلومات السريرية الشاملة.
حالات استخدام قاعدة بيانات MIMIC-III السريرية الإصدار 1.4
- البحث السريري
- أدوات دعم القرار
- نماذج التعلم الآلي
- دراسات قابلية التكرار
- تحليل السجلات الصحية الإلكترونية
- معالجة اللغات الطبيعية
