Deskripsi
AlphaFold Server adalah layanan web yang menghasilkan prediksi struktur biomolekuler yang sangat akurat, termasuk protein, DNA, RNA, ligan, dan ion. Ini didukung oleh model AlphaFold 3 terbaru, yang meningkatkan kemampuan untuk memodelkan interaksi biomolekuler yang kompleks. Pengguna dapat memasukkan berbagai jenis molekul biologis dan menerima prediksi terperinci tentang struktur dan interaksinya.
Server ini memungkinkan pemodelan struktur yang terdiri dari beberapa molekul biologis, termasuk protein, DNA, RNA, dan berbagai ligan serta ion. Ini mendukung berbagai ligan dan ion yang umum secara biologis, serta modifikasi pasca-translasi asam amino dan asam nukleat. Proses pemodelan dibatasi oleh sistem token, di mana total ukuran pekerjaan dibatasi hingga 5.000 token, memastikan pemrosesan yang efisien dan prediksi yang akurat.
AlphaFold Server dirancang untuk penggunaan non-komersial dan mengharuskan pengguna untuk mematuhi syarat layanan tertentu. Pengguna dapat menjalankan hingga 30 pekerjaan per hari, dengan opsi untuk menyimpan pekerjaan dan mengirimkannya nanti jika melebihi kuota mereka. Server ini juga menyediakan metrik kepercayaan untuk prediksi, memungkinkan pengguna untuk menilai keandalan struktur yang dihasilkan. Metrik ini termasuk skor pLDDT, PAE, pTM, dan ipTM, yang membantu pengguna menginterpretasikan akurasi struktur yang diprediksi.
Bagi mereka yang tertarik untuk menyesuaikan prediksi mereka, AlphaFold Server menawarkan opsi untuk menggunakan template kustom dan penyelarasan urutan ganda (MSA). Pengguna dapat mengunggah template dan MSA mereka sendiri untuk meningkatkan proses prediksi, menjadikannya alat yang serbaguna bagi peneliti di bidang pemodelan biomolekuler.
Fitur Inti AlphaFold Server
Prediksi struktur yang akurat
Mendukung protein, DNA, RNA, ligan, ion
Template kustom dan MSA tersedia
Metrik kepercayaan disediakan
Penggunaan non-komersial saja
Batas 30 pekerjaan per hari
Batas token 5000
Antarmuka berbasis web
Cara menggunakan AlphaFold Server?
Masukkan jenis molekul biologis: Masukkan protein, DNA, RNA, atau ligan yang diinginkan.
Sesuaikan template: Unggah template kustom jika diperlukan untuk prediksi tertentu.
Siapkan MSA: Berikan penyelarasan urutan ganda kustom untuk meningkatkan akurasi prediksi.
Kirim pekerjaan: Jalankan pekerjaan prediksi dan tunggu hasilnya diproses.
Kasus Penggunaan AlphaFold Server
- Pemodelan Interaksi Protein
- Prediksi Struktur DNA
- Analisis Interaksi RNA
- Studi Pengikatan Ligan
- Pemodelan Modifikasi Kimia
