Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4

Deskripsi

Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4, yang dirilis pada 4 September 2016, adalah sumber daya yang substansial dan tersedia secara gratis bagi para peneliti di seluruh dunia. Basis data ini terdiri dari data terkait kesehatan yang telah diidentifikasi dari lebih dari empat puluh ribu pasien yang menerima perawatan di unit perawatan kritis Beth Israel Deaconess Medical Center antara tahun 2001 dan 2012. Kumpulan data yang luas ini mencakup berbagai macam informasi, seperti demografi pasien, pengukuran tanda-tanda vital setiap jam, hasil tes laboratorium, rincian prosedur dan obat-obatan yang diberikan, catatan perawat, laporan pencitraan, dan data mortalitas, bahkan hingga setelah pasien keluar dari rumah sakit.

Basis data ini disusun sebagai basis data relasional dengan 26 tabel, yang dihubungkan oleh pengenal seperti SUBJECT_ID, HADM_ID, dan ICUSTAY_ID. Basis data ini menggabungkan data dari berbagai sumber, termasuk sistem informasi perawatan kritis (Philips CareVue dan iMDsoft MetaVision ICU), basis data rekam medis elektronik rumah sakit, dan Social Security Administration Death Master File. Data menjalani proses deidentifikasi yang ketat sesuai dengan standar HIPAA, termasuk pembersihan data terstruktur dan pergeseran tanggal untuk mempertahankan interval sambil menyamarkan identitas pasien. Tanggal digeser ke masa depan, dan usia pasien di atas 89 tahun disamarkan.

MIMIC-III patut diperhatikan karena aksesibilitasnya, populasi pasien ICU yang besar dan beragam yang diwakilinya, serta sifat datanya yang sangat granular. Hal ini menjadikannya alat yang sangat berharga untuk berbagai macam studi analitik, termasuk epidemiologi, peningkatan aturan pengambilan keputusan klinis, dan pengembangan alat rekam medis elektronik. Basis data ini disediakan sebagai kumpulan file CSV, disertai dengan skrip untuk diimpor ke berbagai sistem basis data seperti PostgreSQL, MySQL, dan MonetDB. Akses memerlukan pengguna yang berkualifikasi untuk menyelesaikan pelatihan perlindungan peserta penelitian manusia dan menandatangani perjanjian penggunaan data.

Versi 1.4 memperkenalkan peningkatan signifikan, termasuk penambahan data teks dari menu drop-down untuk pasien Metavision, koreksi rentang data, pemulihan data yang hilang karena transisi sistem, harmonisasi konsep laboratorium, dan peningkatan representasi nilai NULL dalam file CSV. Versi ini juga membedakan adendum ringkasan keluar rumah sakit dan memperbaiki kode LOINC serta data zona waktu. Basis data kini juga tersedia di Google Cloud Platform (GCP) dan Amazon Web Services (AWS), dengan tutorial yang disediakan untuk penggunaannya dengan BigQuery dan Athena.

Sorotan Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4

• Data klinis yang telah diidentifikasi dari lebih dari 40.000 pasien ICU

• Mencakup demografi, tanda-tanda vital, hasil laboratorium, obat-obatan, dan catatan

• Data mencakup periode 2001 hingga 2012

• Tersedia gratis untuk peneliti berkualifikasi di seluruh dunia

• Proses deidentifikasi yang ketat sesuai standar HIPAA

• Disusun sebagai basis data relasional dengan 26 tabel

• Tersedia di Google Cloud Platform (GCP) dan Amazon Web Services (AWS)

• Mendukung penelitian dalam epidemiologi, peningkatan aturan keputusan klinis, dan pengembangan alat

• Data yang sangat granular, termasuk pengukuran fisiologis setiap jam

• Mencakup data mortalitas, baik di rumah sakit maupun setelah keluar rumah sakit

• Data disediakan dalam format CSV dengan skrip impor

• Memerlukan penyelesaian pelatihan perlindungan peserta penelitian manusia

• Memerlukan penandatanganan perjanjian penggunaan data

Memulai dengan Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4

1. 1

   Akses Model: Navigasi ke physionet.org dan temukan basis data MIMIC-III.

2. 2

   Kualifikasi: Selesaikan pelatihan CITI Data atau Specimens Only Research yang diperlukan.

3. 3

   Perjanjian Penggunaan Data: Tandatangani PhysioNet Credentialed Health Data Use Agreement.

4. 4

   Unduh Data: Setelah disetujui, unduh file basis data dari PhysioNetWorks.

5. 5

   Integrasikan Data: Gunakan skrip yang disediakan untuk mengimpor data CSV ke sistem basis data pilihan Anda.

6. 6

   Analisis Data: Mulai penelitian menggunakan informasi klinis yang komprehensif.

Kasus Penggunaan Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4

• Penelitian Klinis
• Alat Pendukung Keputusan
• Model Machine Learning
• Studi Reproduksibilitas
• Analisis Rekam Medis Elektronik
• Pemrosesan Bahasa Alami

FAQ dari Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4

• Apa itu Basis Data Klinis MIMIC-III v1.4?

  MIMIC-III v1.4 adalah basis data besar yang dapat diakses secara gratis, berisi data klinis yang telah diidentifikasi dari lebih dari 40.000 pasien unit perawatan intensif di Beth Israel Deaconess Medical Center antara tahun 2001 dan 2012.

• Siapa yang dapat mengakses basis data MIMIC-III?

  Akses diberikan kepada pengguna berkualifikasi yang telah menyelesaikan pelatihan yang diperlukan dalam perlindungan peserta penelitian manusia dan menandatangani perjanjian penggunaan data.

• Jenis data apa saja yang termasuk dalam MIMIC-III?

  Basis data ini mencakup demografi, tanda-tanda vital, hasil tes laboratorium, prosedur, obat-obatan, catatan perawat, laporan pencitraan, dan data mortalitas.

• Apakah MIMIC-III tersedia di platform cloud?

  Ya, MIMIC-III tersedia di Google Cloud Platform (GCP) dan Amazon Web Services (AWS).

• Bagaimana privasi pasien dilindungi dalam MIMIC-III?

  Semua data diidentifikasi sesuai dengan standar HIPAA, termasuk pembersihan data terstruktur dan pergeseran tanggal untuk menyamarkan identitas pasien.

• Apa saja peningkatan utama dalam versi 1.4?

  Versi 1.4 meningkatkan kualitas data, menambahkan data teks untuk pasien Metavision, memperbaiki rentang data, memulihkan data yang hilang, dan meningkatkan konsistensi data.

• Apa format data MIMIC-III?

  Basis data ini disediakan sebagai kumpulan file comma-separated value (CSV).

• Pelatihan apa yang diperlukan untuk mengakses MIMIC-III?

  Peneliti harus menyelesaikan kursus yang diakui dalam perlindungan peserta penelitian manusia yang mencakup persyaratan Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA).

• Bisakah MIMIC-III digunakan untuk penelitian machine learning?

  Ya, sifat MIMIC-III yang komprehensif dan granular membuatnya cocok untuk berbagai studi machine learning dan analitik.

• Berapa DOI untuk MIMIC-III v1.4?

  DOI untuk MIMIC-III v1.4 adalah https://doi.org/10.13026/C2XW26.